MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4

Total Repeats: 1024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008506	A	7	7	17	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008506	TTA	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
3	NC_008506	TGT	2	6	115	120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326610
4	NC_008506	AT	3	6	163	168	50 %	50 %	0 %	0 %	116326610
5	NC_008506	ATC	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326610
6	NC_008506	ACC	2	6	303	308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326610
7	NC_008506	GCC	2	6	313	318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326610
8	NC_008506	CTG	3	9	338	346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326610
9	NC_008506	GCAA	2	8	364	371	50 %	0 %	25 %	25 %	116326610
10	NC_008506	ATT	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
11	NC_008506	TGC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326610
12	NC_008506	TCT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326610
13	NC_008506	GTTT	2	8	531	538	0 %	75 %	25 %	0 %	116326610
14	NC_008506	TTC	3	9	549	557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326610
15	NC_008506	TAA	2	6	592	597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326610
16	NC_008506	CAA	2	6	608	613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
17	NC_008506	CAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
18	NC_008506	AAC	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
19	NC_008506	CAAT	2	8	926	933	50 %	25 %	0 %	25 %	116326610
20	NC_008506	TGT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326610
21	NC_008506	AGC	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326610
22	NC_008506	CAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
23	NC_008506	AGA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
24	NC_008506	GATT	2	8	1185	1192	25 %	50 %	25 %	0 %	116326610
25	NC_008506	AAC	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
26	NC_008506	GA	3	6	1289	1294	50 %	0 %	50 %	0 %	116326610
27	NC_008506	TGG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326610
28	NC_008506	ATT	2	6	1332	1337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
29	NC_008506	CA	3	6	1341	1346	50 %	0 %	0 %	50 %	116326610
30	NC_008506	AAG	2	6	1423	1428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
31	NC_008506	CCT	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326610
32	NC_008506	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
33	NC_008506	AGGT	2	8	1518	1525	25 %	25 %	50 %	0 %	116326610
34	NC_008506	GTA	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326610
35	NC_008506	CCA	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326610
36	NC_008506	TCA	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326610
37	NC_008506	AGAT	2	8	1682	1689	50 %	25 %	25 %	0 %	116326610
38	NC_008506	AGAT	2	8	1741	1748	50 %	25 %	25 %	0 %	116326610
39	NC_008506	GA	3	6	1754	1759	50 %	0 %	50 %	0 %	116326610
40	NC_008506	ATTA	2	8	1810	1817	50 %	50 %	0 %	0 %	116326610
41	NC_008506	CTC	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326611
42	NC_008506	TGA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326611
43	NC_008506	TAA	2	6	1866	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326611
44	NC_008506	TCA	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
45	NC_008506	CAT	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
46	NC_008506	TCC	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326611
47	NC_008506	TGCAA	2	10	1980	1989	40 %	20 %	20 %	20 %	116326611
48	NC_008506	CTA	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
49	NC_008506	GAGC	2	8	2068	2075	25 %	0 %	50 %	25 %	116326611
50	NC_008506	CAA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326611
51	NC_008506	AG	3	6	2108	2113	50 %	0 %	50 %	0 %	116326611
52	NC_008506	TCTCT	2	10	2117	2126	0 %	60 %	0 %	40 %	116326611
53	NC_008506	CAA	2	6	2132	2137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326611
54	NC_008506	TCC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008506	TCA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
56	NC_008506	AGT	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326612
57	NC_008506	TGC	2	6	2253	2258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326612
58	NC_008506	CTT	2	6	2267	2272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
59	NC_008506	CTT	3	9	2423	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
60	NC_008506	CAG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326612
61	NC_008506	TCA	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
62	NC_008506	AAG	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
63	NC_008506	TTG	2	6	2718	2723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326612
64	NC_008506	CAT	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
65	NC_008506	T	6	6	2861	2866	0 %	100 %	0 %	0 %	116326612
66	NC_008506	AAG	3	9	2874	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
67	NC_008506	CTT	2	6	2888	2893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
68	NC_008506	TTG	2	6	2906	2911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326612
69	NC_008506	GAA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
70	NC_008506	TCA	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
71	NC_008506	TTC	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
72	NC_008506	CAC	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326612
73	NC_008506	TCTGT	2	10	3122	3131	0 %	60 %	20 %	20 %	116326612
74	NC_008506	TAA	2	6	3254	3259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
75	NC_008506	T	7	7	3271	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	116326613
76	NC_008506	AAC	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326613
77	NC_008506	TTC	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
78	NC_008506	CTT	2	6	3487	3492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
79	NC_008506	ATT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326613
80	NC_008506	CGA	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326613
81	NC_008506	GTG	2	6	3571	3576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326613
82	NC_008506	ATA	2	6	3638	3643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
83	NC_008506	TAA	2	6	3700	3705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
84	NC_008506	CTT	2	6	3736	3741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
85	NC_008506	TTG	2	6	3751	3756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326613
86	NC_008506	ACC	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326613
87	NC_008506	CCA	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326613
88	NC_008506	CAC	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
89	NC_008506	CAAT	2	8	4187	4194	50 %	25 %	0 %	25 %	116326614
90	NC_008506	T	6	6	4194	4199	0 %	100 %	0 %	0 %	116326614
91	NC_008506	TCT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326614
92	NC_008506	ATG	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326614
93	NC_008506	TCAT	2	8	4249	4256	25 %	50 %	0 %	25 %	116326614
94	NC_008506	AAG	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326614
95	NC_008506	ACC	2	6	4263	4268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
96	NC_008506	CCA	2	6	4279	4284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
97	NC_008506	TTC	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326614
98	NC_008506	TTTA	2	8	4371	4378	25 %	75 %	0 %	0 %	116326614
99	NC_008506	ATAC	2	8	4411	4418	50 %	25 %	0 %	25 %	116326614
100	NC_008506	TAC	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326614
101	NC_008506	T	6	6	4458	4463	0 %	100 %	0 %	0 %	116326614
102	NC_008506	ATAG	2	8	4467	4474	50 %	25 %	25 %	0 %	116326614
103	NC_008506	GTAC	2	8	4483	4490	25 %	25 %	25 %	25 %	116326614
104	NC_008506	T	6	6	4601	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	116326614
105	NC_008506	TGA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326615
106	NC_008506	CAT	2	6	4665	4670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326615
107	NC_008506	TCA	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326615
108	NC_008506	CGA	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326615
109	NC_008506	CTG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326615
110	NC_008506	TTTA	2	8	4888	4895	25 %	75 %	0 %	0 %	116326615
111	NC_008506	CAA	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326615
112	NC_008506	GTCC	2	8	4935	4942	0 %	25 %	25 %	50 %	116326615
113	NC_008506	CTT	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326615
114	NC_008506	CAA	3	9	5028	5036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008506	CCT	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008506	GTAGAA	2	12	5080	5091	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008506	TCA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008506	CAAA	2	8	5157	5164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008506	T	6	6	5184	5189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008506	T	9	9	5191	5199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008506	T	7	7	5205	5211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008506	A	6	6	5212	5217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008506	ATT	2	6	5234	5239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008506	TCA	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008506	GTTT	2	8	5419	5426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008506	TTGT	2	8	5437	5444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008506	A	7	7	5499	5505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008506	GAAA	2	8	5515	5522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008506	A	6	6	5538	5543	100 %	0 %	0 %	0 %	116326616
130	NC_008506	CGA	2	6	5544	5549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326616
131	NC_008506	A	6	6	5554	5559	100 %	0 %	0 %	0 %	116326616
132	NC_008506	ACCATA	2	12	5586	5597	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116326616
133	NC_008506	ATA	2	6	5604	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326616
134	NC_008506	TGG	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326616
135	NC_008506	GAA	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326616
136	NC_008506	A	6	6	5767	5772	100 %	0 %	0 %	0 %	116326616
137	NC_008506	A	6	6	5784	5789	100 %	0 %	0 %	0 %	116326616
138	NC_008506	CTT	2	6	5958	5963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326616
139	NC_008506	AAGG	2	8	6099	6106	50 %	0 %	50 %	0 %	116326616
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156	NC_008506	T	6	6	6823	6828	0 %	100 %	0 %	0 %	116326617
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173	NC_008506	TCA	2	6	7935	7940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_008506	TCT	2	6	7941	7946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_008506	CTA	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_008506	TCA	2	6	8071	8076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_008506	A	6	6	11768	11773	100 %	0 %	0 %	0 %	116326621
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400	NC_008506	A	7	7	18236	18242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_008506	T	6	6	18405	18410	0 %	100 %	0 %	0 %	116326624
405	NC_008506	TCT	2	6	18418	18423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326624
406	NC_008506	GCT	2	6	18439	18444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326624
407	NC_008506	TGCTGA	2	12	18537	18548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116326624
408	NC_008506	TTG	2	6	18558	18563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326624
409	NC_008506	GGA	2	6	18622	18627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326624
410	NC_008506	GTC	2	6	18628	18633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326624
411	NC_008506	TTG	2	6	18708	18713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326624
412	NC_008506	TTA	2	6	18847	18852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326624
413	NC_008506	TGA	2	6	18888	18893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326624
414	NC_008506	TTA	2	6	18961	18966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326624
415	NC_008506	CAT	2	6	19064	19069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326624
416	NC_008506	TTG	2	6	19110	19115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326624
417	NC_008506	CTA	2	6	19162	19167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326624
418	NC_008506	TAA	2	6	19178	19183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326624
419	NC_008506	TGA	2	6	19197	19202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326624
420	NC_008506	TGC	2	6	19206	19211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326624
421	NC_008506	T	6	6	19263	19268	0 %	100 %	0 %	0 %	116326624
422	NC_008506	CAA	2	6	19313	19318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326624
423	NC_008506	TGA	2	6	19490	19495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326624
424	NC_008506	CAA	2	6	19571	19576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326624
425	NC_008506	CTC	2	6	19748	19753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326624
426	NC_008506	TAA	2	6	19757	19762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326624
427	NC_008506	CTGT	2	8	19774	19781	0 %	50 %	25 %	25 %	116326624
428	NC_008506	GAA	2	6	19782	19787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326624
429	NC_008506	CCA	2	6	19804	19809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326624
430	NC_008506	CAT	2	6	19835	19840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326624
431	NC_008506	T	7	7	19965	19971	0 %	100 %	0 %	0 %	116326624
432	NC_008506	GTACTT	2	12	19972	19983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116326624
433	NC_008506	GCT	2	6	20020	20025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326624
434	NC_008506	ACTAC	2	10	20029	20038	40 %	20 %	0 %	40 %	116326624
435	NC_008506	AAT	2	6	20082	20087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_008506	CTTG	2	8	20100	20107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
437	NC_008506	AATAT	2	10	20112	20121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_008506	TGT	2	6	20173	20178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_008506	ATA	2	6	20234	20239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326625
440	NC_008506	CAC	2	6	20245	20250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326625
441	NC_008506	AAGA	2	8	20372	20379	75 %	0 %	25 %	0 %	116326625
442	NC_008506	GAT	2	6	20623	20628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326625
443	NC_008506	AAT	2	6	20641	20646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326625
444	NC_008506	ATC	2	6	20648	20653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326625
445	NC_008506	CAT	2	6	20815	20820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326625
446	NC_008506	ATA	2	6	20822	20827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326625
447	NC_008506	CCA	2	6	20834	20839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326625
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449	NC_008506	TTG	2	6	20973	20978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326625
450	NC_008506	ATC	2	6	20981	20986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326625
451	NC_008506	T	7	7	20998	21004	0 %	100 %	0 %	0 %	116326625
452	NC_008506	TTC	2	6	21007	21012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326625
453	NC_008506	TTGA	2	8	21014	21021	25 %	50 %	25 %	0 %	116326625
454	NC_008506	T	8	8	21049	21056	0 %	100 %	0 %	0 %	116326625
455	NC_008506	ATA	2	6	21110	21115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326626
456	NC_008506	AGG	2	6	21122	21127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326626
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458	NC_008506	A	6	6	21143	21148	100 %	0 %	0 %	0 %	116326626
459	NC_008506	TAA	2	6	21154	21159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326626
460	NC_008506	AAT	2	6	21180	21185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326626
461	NC_008506	TAA	2	6	21204	21209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326626
462	NC_008506	CTC	2	6	21258	21263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326626
463	NC_008506	TGTT	2	8	21391	21398	0 %	75 %	25 %	0 %	116326626
464	NC_008506	AAGT	2	8	21419	21426	50 %	25 %	25 %	0 %	116326626
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466	NC_008506	ATT	2	6	21506	21511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326626
467	NC_008506	AAAGAT	2	12	21568	21579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116326626
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469	NC_008506	TCA	2	6	21768	21773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326626
470	NC_008506	CCA	2	6	21847	21852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326626
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472	NC_008506	AGA	2	6	21957	21962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326626
473	NC_008506	ATAA	2	8	21980	21987	75 %	25 %	0 %	0 %	116326626
474	NC_008506	ATC	2	6	21995	22000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326626
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479	NC_008506	T	6	6	22121	22126	0 %	100 %	0 %	0 %	116326627
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482	NC_008506	TAG	2	6	22459	22464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326627
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488	NC_008506	CAA	2	6	22786	22791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326627
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492	NC_008506	T	6	6	23061	23066	0 %	100 %	0 %	0 %	116326628
493	NC_008506	CTT	3	9	23085	23093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326628
494	NC_008506	CGAG	2	8	23108	23115	25 %	0 %	50 %	25 %	116326628
495	NC_008506	AAAT	2	8	23116	23123	75 %	25 %	0 %	0 %	116326628
496	NC_008506	ATC	2	6	23179	23184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326628
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499	NC_008506	TTC	3	9	23366	23374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326628
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